.htaccess 内の RewriteBase 設定が、MODx をインストールしたディレクトリと異なっていないかご確認ください。
http://******.heteml.jp/modx/ にインストールした場合、RewriteBase は以下のようになります。
RewriteBase /modx/
※MODx をインストールしたディレクトリ名と一致させます。
また、 .htaccess で php_flag, php_value をご利用いただけません。
php_falg, php_value は必ずコメントアウトしてください。
#php_flag register_globals Off